Слова имеют разное значение. Болотный — относящийся к болоту; живущий или произрастающий на болоте. Примеры: болотная вода, болотная трава. Болотистый же — изобилующий болотами, заболоченный; топкий, как болото. Примеры: болотистая местность, болотистая река.