Амнистия — это юридический термин, обозначающий освобождение от наказания, уголовной ответственности. В русском языке слово «амнистия» требует использования родительного падежа после себя. Есть простой способ это запомнить: cлово «освобождение» требует после себя родительного падежа: «освобождение (кого?) заключённых». В этом случае «заключённые» — это объект действия (те, кого освобождают). По этой же логике, правильным вариантом употребления слова «амнистия» будет «амнистия (кого?) заключённых».